近年来，学院主办或承办了“教育部高等学校基础医学类教学指导委员会暨中国高等教育学会医学教育专业委员会基础医学教育联合研讨会”、“中国认知科学学会化学感知分会第一届学术年会”，举办免疫与代谢国际学术论坛、医学遗传学彭城国际会议、重大慢病精准诊疗暨生物医药技术与转化医学国际会议、淮海经济区病理高峰论坛、基础医学前沿发展论坛等国际和全国学术会议20余次。邀请了教育部吴岩副部长、陈国强院士等国内外知名专家学者80余人到学院访问与学术交流。