生物化学教研室前身是1958年建校伊始成立的医用化学教研室，1963年正式成立生物化学教研室。1984年成立江苏省生物化学重点实验室，1994年建立生物化学与分子生物学研究中心，2005年成立江苏省脑病生物信息重点实验室。生物化学与分子生物学是生物化学教研室的依托学科，该学科为我校传统优势学科以及江苏省“九五”，“十五”，“十一五”重点学科。2010 年成为“江苏高校优势学科建设工程一期项目”立项学科（生物学），2014 年成为“江苏高校优势学科建设工程二期项目”立项学科（医药生物学）。2018 年成为“江苏高校优势学科建设工程三期项目”立项学科（基础医学）。1984 年获批硕士学位授予点，2013 年作为生物学一级学科核心，获批博士学位授权，开始独立招收博士研究生。2014 年，建立生物学博士后流动站。学科先后获国家教委科学技术进步二等奖，教育部自然科学二等奖，中华医学科技二等奖，教育部自然科学二等奖和江苏省人民政府授予的科学技术二等奖，江苏省科技进步二等奖、三等奖等。

教研室现有教职工48人，其中教授12人、副教授14人、高级实验师3人，其中江苏特聘教授 6 人，博士生导师 12 人，硕士生导师 26 人。入选教育部新世纪人才 1 人，江苏省有突出贡献的中青年专家 1 人，江苏省“333 工程”第二层次 1 人，江苏省“333 工程”第三层次 4 人，江苏省“六大人才高峰”4 人，省“青蓝工程”科技创新团队学术带头人 2 人，江苏省科协青年科技人才托举工程 1 人，江苏省“青蓝工程”中青年学术带头人 3 人。江苏省“青蓝工程”优秀骨干教师 4 人，双创博士12 人，校特聘教授 1 人。近三年来承担国家级、省部级等科研课题和人才项目35 项，在PNAS, Cell Reports, Nature Communications 等权威期刊等期刊发表研究论文 53 篇。

本教研室承担全校19个本科专业的15门课程及硕士、博士研究生的教学与培养工作。 1995年，生物化学课程被评为江苏省一类优秀课程；2004年，生物化学与分子生物学课程被评为江苏省二类优秀课程；2008年，医学生物化学与分子生物学成为江苏省精品课程；2019年，建设省高校在线开放课程；2025年，生物化学与分子生物学课程被评为国家级一流本科课程线下课程。作为主编单位编写“十二五”普通高等教育本科国家级规划教材及全国高等医药院校规划教材《生物化学与分子生物学》和省级普通高等教育临床医学专业 5+3 “十四五”规划教材《生物化学》；参编《生物化学与生物物理进展》。